Detección del SARS-CoV-2 mediante RT-qPCR utilizando saliva en pacientes ambulatorios con estudio de COVID-19

Resumen Introducción: La pandemia de COVID-19 ha afectado a millones de personas en todo el mundo. La identificación de sujetos infectados ha sido importante para el control. Objetivo: Evaluar el rendimiento de una reacción de polimerasa en cadena (RPC) cuantitativa en tiempo real (en inglés: RT-qPCR) para SARS-CoV-2, utilizando saliva como matriz en comparación con un hisopado nasofaríngeo (HNF). Metodología: Se reclutaron adultos en atención ambulatoria, la mayoría sintomáticos. Fueron estudiadas 530 muestras pareadas de saliva e HNF con RT-qPCR. Resultados: Fueron positivas 59 muestras de HNF y 54 de saliva. La sensibilidad con saliva fue 91%, especificidad 100%, el valor predictor positivo (VPP) 100%, valor predictor negativo (VPN) 98%. El índice Kappa fue de 0,95 y LR-0,08. En promedio, el umbral de ciclo (en inglés cycle threshold-CT) de la saliva fue 3,99 puntos más alto que los de HNF (p < 0,0001) mostrando que la carga viral (CV) es menor en saliva. La carga viral en ambas disminuyó con el tiempo después del inicio de los síntomas. El muestreo de saliva fue preferido por los sujetos en lugar de HNF. Conclusión: Este estudio demuestra que la RPC para SARS-CoV-2 utilizando saliva, es adecuada para el diagnóstico de COVID-19 en adultos ambulatorios, especialmente en la etapa temprana de los síntomas.

Abstract Background: The COVID-19 pandemic has affected millions of people around the world. Part of control strategies is testing a large proportion of the population to identify and isolate the infected subjects. Aim: To evaluate the SARS-CoV-2 detection by the performance of a reverse transcription and quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR) against SARS-CoV-2, using saliva as a matrix compared to a nasopharyngeal swab (NPS) to simplify obtaining a diagnostic sample. Methods: Adults in outpatient care were recruited, 95% of them symptomatic. We studied 530 paired saliva and NPS samples by SARS-CoV-2 RT-qPCR. Results: Fifty-nine individuals tested positive in NPS and 54 in saliva samples. Sensitivity for saliva sample was 91%, specificity 100%, positive predictive value (PPV) 100%, negative predictive value (NPV) 98%. The Kappa index was 0.95 and LR-0.08. On average, the cycle threshold (CT) of saliva was 3.99 points higher than those of NPS (p < 0.0001) showing that viral load (VL) is lower in saliva than in NPS. Viral load in both decreased over the time after onset of symptoms. Saliva sampling was preferred by subjects instead of NPS. Conclusion: This study demonstrates that SARS-CoV-2 RT-qPCR using saliva, even with lower VL, is suitable for the diagnosis of COVID-19 in outpatient adults, especially at early stage of symptoms.

Tifus de los matorrales, una enfermedad emergente en Chile / Scrub typhus, an emerging infectious disease in Chile

Resumen El tifus de los matorrales, causado por Orientia tsutsugamushi y transmitido por larvas de ácaros trombicúlideos de roedores silvestres es una rickettsiosis endémica en el Asia Pacífico. Luego del primer caso identificado en Chile en el año 2006, nuestro grupo ha identificado más de 30 casos a partir del año 2015. Los casos se han presentado con un marcado predominio en meses de verano, y su presentación clínica incluye fiebre, exantema y una mancha negra en el sitio de inoculación. Otros hallazgos frecuentes han sido cefalea intensa, sudoración nocturna, aumento de PCR, VHS y transaminasas hepáticas. La gran mayoría de los pacientes se han diagnosticado en el sur de Chile (principalmente la isla de Chiloé), pero recientemente también se han presentado casos en la Región Metropolitana, en personas volviendo de viajes al sur de Chile. Los médicos clínicos deben estar informados de esta enfermedad emergente en el país, de modo de sospecharla e iniciar terapia empírica con doxiciclina. La confirmación de estos casos con los métodos diagnósticos disponibles en Chile contribuirá a una mejor comprensión del rango epidemiológico y la relevancia clínica de esta infección nueva en el país.

Scrub typhus, caused by Orientia tsutsugamushi and transmitted by larvae of trombiculid mites, is an endemic rickettsiosis in the Asia Pacific region. After the first identification of a case in Chile in 2006, more than 30 cases have been diagnosed by our group since 2015. Cases were detected predominantly during the Chilean summer months. Patients presented with fever, rash, and a typical eschar at the inoculation site; other frequent findings were intense headache, night sweats, increased laboratory markers of inflammation and transaminases. The vast majority of cases have been diagnosed in southern Chile (mainly Chiloé Island), although recently some cases were also identified in the central Metropolitan Region in patients returning from trips to southern Chile. Physicians attending Chilean patients should be aware of this emerging infection to be able to initiate empirical therapy with doxycycline. The confirmation of cases by the diagnostic methods available in Chile will contribute to a better understanding of the epidemiological and clinical relevance of this emerging infection in South America.

Vacuna contra fiebre amarilla para viajeros chilenos a Brasil. Consideraciones prácticas / Yellow fever vaccination for Chilean tourists visiting Brazil. Practical considerations

Resumen La aparición de fiebre amarilla en las costas brasileñas, lugares de alto interés turístico, ha provocado una alta demanda de vacunación. Este articulo entrega respuestas a las principales consultas sobre la vacuna de fiebre amarilla y puede servir como guía para médicos no expertos en Medicina del Viajero.

Due to the recent yellow fever outbreak affecting the costal region of Brazil, including main touristic destinations, there is a high demand of yellow fever vaccination. This publication addresses the most relevant practical issues regarding this vaccine for tourists visiting Brazil and aims to serve as a guideline for non-expert physicians in Chile and elsewhere.

Feohifomicosis nasal por Curvularia spicifera en un paciente pediátrico con neutropenia y leucemia mieloide aguda / Nasal phaeohyphomycosis by Curvularia spicifera in pediatric patient with neutropenia and acute myeloid leukemia

There are very few reports of pediatric patients with infections by dematiaceous filamentous fungi. In this publication we report a case of invasive fungal infection of the nasal septum by Curvularia spicifera in a pediatric patient with acute myeloid leukemia. The patient presented with a painful scabby wound in the nasal vestibule. Culture and universal PCR were consistent with Curvularia spicifera. Early management with surgical debridement and bi-associated antifungal therapy achieved complete resolution of the lesions, with no evidence of dissemination and relapses. Clinical management of these fungal infections represents a challenge as the antifungal selection and duration of therapy is not yet well stablished.

Existen pocos reportes de infecciones por hongos dematiáceos en pediatría. Comunicamos el caso de una infección fúngica invasora del tabique nasal en un niño con una leucemia mieloide aguda, que se presentó como una lesión costrosa dolorosa en el vestíbulo nasal. Se realizó desbridamiento quirúrgico precoz y recibió tratamiento antifúngico biasociado, lográndose resolución completa de las lesiones, sin diseminación ni recaídas. El cultivo y la RPC universal fueron compatibles con Curvularia spicifera. El manejo de estas infecciones fúngicas representa un desafío, considerando que la elección del agente antifúngico y la duración de la terapia no están completamente establecidas.

Descripción clínica y epidemiológica de la infección por Clostridium difficile en población pediátrica / Clinic and epidemiologic description of Clostridium difficile infection in a pediatric population

Background: Clostridium difficile (CUj-associated disease (CDAD) and the role of the hypervirulent strain NAP1 have not been well characterized in Pediatrics. Aims: To describe clinical features of CDAD, and to estimate NAP1 frequency and association with disease severity in Pediatrics. Methods: Descriptive, transversal surveillance of diarrheal episodes in Chilean children, hospitalized between February 2012 and December 2013, positive for CD by molecular diagnosis. Results: A total of 66 episodes of diarrhea with identification of CD occurred thougout the study period in children between 1 month and 19 years of age of which 39% were younger than one year old. CD acquisition was predominantly nosocomial and the most common risk factors were: presence of comorbidities (98.6%), use of antibiotics (93.9%), proton pump inhibitors (84.8%), invasive mechanic ventilation (54.5%), feeding tube (48.5%) and immunosuppression (40.9%). Clinical course was mostly mild, but 12 cases presented an unfavorable course, of which 3/26 occurred in children less than one year. Only one case was positive for NAP1 and had a mild course. Conclusion: Diarrhea with identification of CD was present throughout all pediatric ages, including children less than one year old. Analytical and longitudinal studies are required to better characterize the pathogenic role of CD in this age group. CDAD occurred mostly in patients with risk factors, and the clinical course was predominantly mild.

Introducción: Aún no ha sido bien caracterizada la infección por Clostridium difficile ni el rol de la cepa hipervirulenta NAP1 en pediatría. Objetivos: Describir las características clínicas de la infección por C. difficile, la frecuencia de NAP1 y su asociación con gravedad en población pediátrica. Material y Método: Estudio transversal, descriptivo, de episodios de diarrea con identificación molecular de C. difficile en niños chilenos hospitalizados entre febrero de 2012 y diciembre de 2013. Resultados: Se estudiaron 66 episodios de diarrea por C. difficile, en niños entre 1 mes y 19 años, teniendo 39% menos de un año de edad. La adquisición fue predominantemente nosocomial. Los factores de riesgo más frecuentes fueron: co-morbilidades, uso de antimicrobianos, inhibidores de bomba de protones, ventilación mecánica invasora, sonda de alimentación e inmunosupresión. El curso clínico fue mayoritariamente benigno, con 12 casos de evolución desfavorable incluyendo lactantes bajo un año de edad. Un niño presentó la cepa NAP1, con un curso clínico leve. Discusión: En esta serie, la diarrea con identificación de C. difficile se presentó en niños de todas las edades, incluyendo aquellos bajo un año. Se necesitan estudios analíticos y longitudinales para determinar el rol patógeno en este último grupo etario. La infección afecta a niños con factores de riesgo y es de evolución predominantemente satisfactoria.

Aproximación clínica y principales rickettsiosis transmitidas por garrapatas presentes en Latinoamérica / Clinical approach and main tick-borne rickettsiosis present in Latin America

Tick-borne rickettsial diseases are potentially life threatening infections that in Latin America have an emerging and reemerging character. Until few years ago, Rickettsia rickettsia was the only tick-borne rickettsia present in America; but nowadays several other species such as R. parkeri and R. massiliae are causing disease in humans in the region. In addition, new species are being described; although their pathogenicity has not been confirmed they should be considered as potential pathogens. Since the microbiological diagnosis of rickettsioses can take days or weeks, a high clinical suspicion and early start of appropriate treatment are crucial. In this review the distribution and main clinical manifestations of tick-borne rickettsial diseases in Latin America are detailed. Since R. felis has been found in ticks and the role of this vector has not been clarified, we have included a section about this pathogen.

Las rickettsiosis transmitidas por garrapatas son infecciones potencialmente letales, que en Latinoamérica tienen carácter emergente y re-emergente. Hasta hace escasos años, la única rickettsiosis transmitida por garrapatas era causada por Rickettsia rickettsii, pero en la actualidad existen otras especies como R. parkeri y R. massiliae que están provocando enfermedad en humanos en la región. Por otro lado, se están describiendo candidatos a nuevas especies de Rickettsia, que aunque no han probado su patogenicidad deben considerarse como potencialmente patógenos. Dado que el diagnóstico microbiológico puede tardar días o semanas, resulta fundamental una alta sospecha clínica y la instauración precoz de un tratamiento adecuado. En esta revisión se detalla la distribución y principales manifestaciones clínicas de las rickettsiosis transmitidas por garrapatas en Latinoamérica. Se ha incluido una sección sobre la infección por R. felis, por haberse encontrado esta especie en garrapatas, y no haberse aclarado el papel de este vector en su ciclo epidemiológico.

Concordancia del hisopado nasal con el hisopado nasofaríngeo en la detección de virus respiratorios por inmunofluorescencia directa / Concordance of nasal swabs and nasopharyngeal swabs in the detection of respiratory viruses by direct immunofluorescence

Background: The most used test for the diagnosis of viral respiratory infection is the detection of viral antigens by direct immunofluorescence (DFA), in samples taken by nasopharyngeal swab (NPS) or aspirate (NPA). It would be desirable to have a less uncomfortable technique to obtain a sample from the patient, but of equal performance. Aim: To evaluate the diagnostic agreement between nasal swab (NS) and nasopharyngeal swab (NPS) in the detection of respiratory viruses by DFA and compare the degree of discomfort of both techniques in pediatric patients. Methodology: Cross-sectional study in children who consulted to a pediatric emergency service with respiratory symptoms. Two samples (NPS and NS) per child were collected. The concordance between the two was determined by Kappa (K) coefficient and the degree of discomfort by a visual pain scale. Results: We obtained 112 samples from 56 children, one by each technique. 82.1% were concordant, K = 0.61 (CI95%, 0.39-0.83) for the detection of any virus, and K = 0.69 (CI 95%, 0.46- 0.92) and K = 0.76 (CI 95%, 0.51-1) for syncytial respiratory virus and influenza A detection, respectively. The degree of discomfort was significantly lower for the NS. Conclusion: There is considerable agreement in the detection of respiratory viruses by DFA between samples obtained by NS and NPS, but not enough to recommend a change in the sampling method in this population.

Introducción: El examen más utilizado para el diagnóstico de infecciones respiratorias virales es la detección de antígenos virales por inmunofluorescencia directa (IFD) en muestras tomadas por hisopado nasofaríngeo (HNF) o aspirado (ANF). Sería deseable contar con una técnica de toma de muestra menos molesta para el paciente pero de igual rendimiento que las mencionadas. Objetivo: Evaluar la concordancia diagnóstica entre hisopado nasal (HN) e HNF en la detección de virus respiratorios por IFD y comparar el grado de molestia de ambas técnicas en pacientes pediátricos. Métodos: Estudio transversal en niños que consultaron en una urgencia pediátrica por síntomas respiratorios agudos. Se recolectaron dos muestras (por HNF y HN) por cada niño para detección viral mediante IFD. Se determinó la concordancia entre ambas mediante coeficiente Kappa (K) y se analizó el grado de molestia que causa la toma de muestra con escala visual. Resultados: Se obtuvo 112 muestras en 56 niños, una por cada técnica. La concordancia entre ellas fue de 82,1%, con un K = 0,61 (IC95% 0,39-0,83) para la detección de cualquier virus, K = 0,69 (IC 95% 0,46- 0,92) para virus respiratorio sincicial y K = 0,76 (IC 95% 0,51-1) para influenza A. El grado de molestia fue significativamente menor para el HN. Conclusiones: Existe una concordancia considerable en la detección de virus respiratorios mediante IFD en muestras tomadas por HNF como HN, pero insuficiente como para recomendar un cambio de metodología de la toma de muestra en esta población.

Infecciones asociadas a la atención en salud (IAAS) en pacientes pediátricos post-operados de cardiopatías congénitas / Nosocomial infections after cardiac surgery in infants and children with congenital heart disease

Introduction: Nosocomial infections generate high morbidity and mortality in children undergoing cardiac surgery. Objective: To determine risk factors for nosocomial infections in children after congenital heart surgery. Methods: A retrospective case-control study, in patients younger than 15 years undergoing surgery for congenital heart disease from January 2007 to December 2011 admitted to the Pediatric Critical Patient Unit (UPC-P) in a university hospital. For cases, the information was analyzed from the first episode of infection. Results: 39 patients who develop infections and 39 controls who did not develop infection were enrolled. The median age of cases was 2 months. We identified a number of factors associated with the occurrence of infections, highlighting in univariate analysis: age, weight, univentricular heart physiology, complexity of the surgical procedure according to RACHS-1 and cardiopulmonary bypass (CPB) time ≥ 200 minutes. Multivariate analysis identified CPB time ≥ 200 minutes as the major risk factor, with an OR of 11.57 (CI: 1.04 to 128.5). Conclusion: CPB time ≥ 200 minutes was the mayor risk factor associated with the development of nosocomial infections.

Introducción: Las infecciones asociadas a la atención en salud (IAAS) generan elevada morbilidad y mortalidad en niños sometidos a cirugía cardíaca. Objetivo: Determinar factores de riesgo que inciden en la ocurrencia de IAAS en niños operados de cardiopatías congénitas. Métodos: Estudio retrospectivo de casos y controles, en pacientes menores de 15 años sometidos a cirugía por cardiopatías congénitas desde enero 2007 a diciembre 2011 admitidos en la Unidad de Paciente Crítico Pediátrico (UPC-P) de un hospital universitario. Para los casos, se analizó la información del primer episodio de infección. Resultados: Se enrolaron 39 pacientes con IAAS y 39 controles operados que no desarrollaron infección. La mediana de edad de los casos fue 2 meses. Se identificó una serie de factores asociados a la ocurrencia de IAAS, destacando en el análisis univariado: edad, peso, fisiología cardíaca tipo univentricular, complejidad del procedimiento quirúrgico según RACHS-1 y tiempo de circulación extracorpórea (CEC) ≥ 200 min. El análisis multivariado identificó al tiempo de CEC ≥ 200 min como el principal factor de riesgo, con un OR de 11,57 (IC: 1,04-128,5). Conclusión: El tiempo de CEC ≥ 200 min fue el factor de riesgo más asociado al desarrollo de IAAS en niños operados de cardiopatías congénitas.

Guías Latinoamericanas de la RIICER para el diagnóstico de las rickettsiosis transmitidas por garrapatas / Latinamerican guidelines of RIICER for diagnosis of tick-borne rickettsioses

Tick-borne rickettsioses are worldwide infectious diseases that are considered emerging and re-emerging. Until recently the only tick-borne rickettsiosis present in Latin America was Rickettsia rickettsii infection, but to date, with the incorporation of new tools as PCR and sequencing and the quick cellular close tube cultures (Shell-vial), new species has been involved as human pathogens. In these guidelines, we offer an update of the microbiological assays for diagnosing rickettsioses. Besides we have included a section in which the most important hard ticks involved in human rickettsioses in Latinoamerica are detailed.

Las rickettsiosis transmitidas por garrapatas son afecciones de distribución mundial, que por diferentes motivos se pueden considerar emergentes y reemergentes. Hasta hace escasos años la única rickettsiosis transmitida por garrapatas en Latinoamérica era la infección por Rickettsia rickettsii, pero en la actualidad y fundamentalmente, gracias a la incorporación de nuevas herramientas para el diagnóstico microbiológico como la reacción en cadena de la polimerasa y secuenciación o el cultivo celular rápido en tubo cerrado, se han descrito e involucrado otras especies de Rickettsia en la producción de patología humana. En estas guías se detallan y describen las diferentes técnicas utilizadas para el diagnóstico microbiológico de las rickettsiosis. Además, se incluye una sección en la que se detallan las especies más importantes de garrapatas duras relacionadas con las rickettsiosis en Latinoamérica, con claves para su clasificación taxonómica.

La vacuna polio oral en lactantes no interfiere con la detección de enterovirus en sangre / Oral polio vaccine in infants does not interfere in detection of enterovirus in blood

Introduction: There is not known if a viraemia post-oral polio vaccine (OPV) is detectable by modern molecular techniques. Such viraemia could affect the performance of the real time-polymerase chain reaction (PCR) for non polio enterovirus (EV) detection, technique of growing clinical use for the study of febrile infants. Objective: To determine viraemia post-first dose of OPV in healthy infants, by molecular techniques. Patients and Methods: 50 infants less than three months without previous VPO were randomized in 5 groups: a control group with pre-vaccination blood sample (BS), group 1 BS at day 2, group 2 BS at day 4, group 3, BS at day 6 and group 4, BS at day 8 post-vaccination. Conventional and specific PCR for poliovirus and real time PCR for non polio EV were performed in BS and in OPV samples. Results: No genetic material of poliovirus was detected in any infant, while in 9 of them (18%) non polio EV was identified. Real time PCR for EV did not amplify poliovirus from OPV samples. Discussion: Results suggest that no post VPO viraemia detectable by molecular methods exists. Considering that real time PCR for EV does not allow to identify polio virus, no false positives of the test are expected as a result of a recent VPO vaccination. We documented presence of non polio EV in blood of healthy asymptomatic infants.

Introducción: No existen estudios que indiquen si la vacuna polio oral (VPO) produce viremia detectable mediante métodos moleculares. Una eventual viremia podría afectar el rendimiento de la RPC tiempo real para detectar enterovirus (EV) no polio, examen de creciente uso clínico en lactantes pequeños con fiebre sin foco. Objetivo: Determinar viremia post VPO en lactantes sanos, por métodos moleculares. Métodos: 50 menores de 3 meses, al momento de recibir su primera VPO se distribuyeron en forma aleatoria en 5 grupos: control, muestra de sangre pre-vacunación; grupo 1, muestra al 2° día; grupo 2, al 4° día; grupo 3, al 6° día y grupo 4, al 8° día post-vacunación. Se realizó RPC convencional específica para virus polio y RPC tiempo real para EV no polio en las muestras de sangre y en muestras de VPO. Resultados: No se identificó presencia de material genético de virus polio en lactante alguno, mientras que en 9 (18%) se identificó presencia de EV no polio. La RPC tiempo real para EV no polio no amplificó material genético a partir de las muestras de VPO. Discusión: Los resultados sugieren que no existe viremia post-VPO detectable por métodos moleculares. Considerando que la RPC tiempo real de EV no polio de uso clínico no permite identificar la presencia de virus polio, estos hallazgos indican que no existirán falsos positivos de este examen como resultado de una vacunación VPO reciente. Adicionalmente se documentó presencia de EV no polio en sangre de lactantes asintomáticos.

Identificación de Rickettsia andeanae en dos regiones de Chile / Detection of Rickettsia andeanae in two regions of Chile

Introduction: Candidatus 'Rickettsia andeanae' is recently recognized specie, with no attributed pathogenic role so far. It has been reported in Amblyomma ticks from Peru, USA and Argentina, and recently in Chile, in one specimen of Amblyomma triste from a rural locality in Arica. Objective: To determine the presence of rickettsial agents in ticks from domestic dogs from two Chilean regions. Methods: A transversal descriptive study in Coquimbo and La Araucanía regions, consisted in households sampling in the cities of Coquimbo and Aingol and nearby rural localities, in spring-summer 2011-2012. One dog per house was examined and ticks were collected when present; after taxonomic identification, gltA and ompA genes were amplified and sequenced. Results: 462 dogs were examined, 255 had ticks (55%). In the cities just Rhipicephalus sanguineus was found; in rural localities also Amblyomma tigrinum. Obtained sequences in 12 specimens from A. tigrinum corresponded to Candidatus 'Rickettsia andeanae'. Conclusions: We documented the presence of R. andeanae in two distant Chilean regions, which is added to its recently finding in the Northern extreme of the country. This new rickettsial agent limits to Amblyomma ticks and rural areas, as it was reported in other American countries and corresponds with this tick habitat.

Introducción: Candidatus 'Rickettsia andeanae', especie de reciente reconocimiento y rol patógeno no precisado, ha sido identificada en garrapatas del género Amblyomma en Perú, E.U.A. y AArgentina y recientemente en Chile, en un espécimen de Amblyomma triste de un sector rural de Arica. Objetivo: Determinar presencia de agentes rickettsiales en garrapatas de perros domésticos de dos regiones de Chile. Métodos: Estudio transversal, descriptivo, en las regiones de Coquimbo y La Araucanía, con muestreo domiciliario en las ciudades de Coquimbo y AAngol y localidades rurales cercanas, en primavera-verano 2011-2012. Se examinó un perro por vivienda, recolectando garrapatas si estaban presentes; luego de su identificación taxonómica fueron sometidas a amplificación y secuenciación de los genes gltA y ompA. Resultados: Se examinaron 462 perros, 255 tenían garrapatas (55%). En las ciudades se encontró exclusivamente Rhipicephalus sanguineus; en las localidades rurales además Amblyomma tigrinum. Las secuencias obtenidas en 12 especímenes de A. tigrinum correspondieron a Candidatus 'Rickettsia andeanae'. Conclusiones: Se documenta presencia de R. andeanae en dos regiones distantes de Chile, lo que se suma a su reciente hallazgo en el extremo norte del país. Este nuevo agente rickettsial se limita a garrapatas del género Amblyomma y a zonas rurales, lo que concuerda con lo documentado en otros países y con el hábitat de esta garrapata.

Exactitud y utilidad diagnóstica de la IgM en infecciones por Bartonella henselae / Accuracy and diagnostic utility of IgM in Bartonella henselae infections

Introduction: Laboratory diagnosis of cat scratch disease (CSD) is based on the determination of specific antibodies anti-Bartonella henselae by different techniques. The CDC recommends IgG by immunofluorescent assay (IFA) as the gold standard. Objective: To determine the accuracy and diagnostic utility of anti-B.henselae IgM by IFA for CSD. Material and Methods: Anti-B. henselae IgG was determined in serum of 108 patients with CSD suspicion; in addition, specific IgM was determined separately and blindly by two thoroughly trained laboratory professionals. We calculated sensitivity (S), specificity (Sp), predictive values both positive (PPV) and negative (NPV), and likelihood ratio (LR) for IgM positive (LR +) and negative (LR-). Results: In 37 patients with positive anti-B.henselae IgG, IgM was positive in 16 and negative in 21; in 71 patients with negative IgG, IgM was negative in 69 and positive in 2. Therefore, IgM showed S 43%, E 97%, PPV 88%, NPV 77%, LR (+) 15 and LR (-) 0.58. Conclusions: The results show that a positive IgM supports, but a negative one does not rule out a B. henselae infection. Therefore, IgG should be still considered as the gold standard for the diagnosis of CSD.

Introducción: El diagnóstico de laboratorio de la enfermedad por arañazo de gato (EAG) se basa en la determinación de anticuerpos específicos anti-Bartonella henselae por distintas técnicas. El CDC de E.U.A. recomienda como estándar de oro la IgG mediante inmunofluorescencia (IF). Objetivo: Determinar la exactitud y utilidad diagnóstica de la IgM anti-B. henselae por IF para EAG. Material y Método: En suero de 108 pacientes a quienes se realizó IgG anti-B. henselae por sospecha de EAG, se determinó la presencia de IgM específica, en forma separada y ciega por dos profesionales de laboratorio ampliamente entrenados. Se calculó sensibilidad (S), especificidad (E), valores predictores positivo (VPP) y negativo (VPN) y likelihood ratio (LR) para una IgM positiva (LR+) y negativa (LR-). Resultados: En 37 pacientes con IgG anti-B. henselae positiva, la IgM fue positiva en 16 y negativa en 11; en 71 pacientes con IgG negativa, la IgM fue negativa en 69 y positiva en 2. Por consiguiente, la IgM presentó S 43%, E 97%, VPP 88%, VPN 77%, LR(+) 15 y LR(-) 0,58. Conclusiones: Los resultados sugieren que una IgM positiva apoya el diagnóstico de EAG, pero una negativa no permite descartarlo. Por tanto, la IgG debe seguir considerándose como el estándar de oro para el diagnóstico de infecciones por B. henselae.

Efectividad de la vacuna antivaricela como profilaxis post exposición en niños chilenos / Effectiveness of varicella vaccine as post exposure prophylaxis in Chilean children

Introduction: Efficacy and effectiveness of varicella vaccine (VV) as post exposure prophylaxis (PEP) strategy have shown discordant results for disease risk reduction, and more consistent results in their ability to attenuate the disease. Aim: To assess the effectiveness of VV as PEP among household contacts. Material and Methods: We followed up 33 children after household exposure to a varicella case, of which 15 received VV as PEP and 18 did not received VV. The presence and severity of the disease were clinically determined. Results: Secondary attack rate was 53% among vaccinated and 89% among non-vaccinated children. Overall effectiveness of VV as PEP was 40% (CI95% 1%-64%). The effectiveness for preventing moderate or severe disease was 63% (CI95% 8%-85%) in the entire group and 77% (CI95% 14%-94%) among children vaccinated during the first 3 days post exposure. Vaccine tolerance was acceptable, with a low number of adverse reactions, all of them mild. Conclusion: The results suggest that VV as PEP is effective among household contacts, especially for reducing the severity of the disease.

Introducción: Los estudios de eficacia y efectividad de la vacuna antivaricela (V AV) como profilaxis post exposición (PPE) han mostrado resultados disímiles en cuanto a la reducción del riesgo de enfermar, y algo más consistentes en su capacidad de atenuar la enfermedad. Objetivo: Evaluar la efectividad de la VAV como PPE utilizada en contactos domiciliarios. Material y Métodos: Se realizó el seguimiento post exposición de 33 contactos domiciliarios de casos de varicela, de los cuales 15 recibieron VAV como PPE y 18 no la recibieron. Se determinó clínicamente el desarrollo de enfermedad y la intensidad de la misma. Resultados: La tasa de ataque secundario fue 53% en vacunados y 89% en no-vacunados, siendo la efectividad global de la VAV como PEP 40% (IC95% 1%-64%). La efectividad para prevenir enfermedad moderada o intensa fue 63% (IC95% 8-85%) en el grupo completo y 77% (IC95% 14-94%) en los niños vacunados durante los primeros tres días post exposición. La tolerancia a la vacuna fue aceptable, con un bajo número de reacciones adversas, todas leves. Conclusión: Los resultados sugieren que la VAV es efectiva como PPE en contactos domiciliarios, especialmente para reducir la intensidad de la enfermedad.

Identificación molecular de Ehrlichia canis en un canino de la ciudad de Arica, Chile / Molecular identification of Ehrlichia canis in a dog from Arica, Chile

We report a molecular confirmed case of canine ehrlichiosis caused by Ehrlichia canis. A 10-year old female crossbred Siberian from the city of Arica, which was infested by ticks, presented hemorrhagic manifestations (hematomas and snout bleeding) and prostration. Blood cell count revealed thrombocytopenia (30,000 platelets/ mm³). Immunochromatographic rapid testing for E. canis IgG was positive. Amplification and sequencing of a fragment of the 16S rRNA gen from a blood sample showed 100% homology with E. canis from Perú. This is the first report of E. canis in Chile, an agent with known zoonotic potential.

Se reporta un caso clínico de ehrlichiosis causada por Ehrlichia canis en un perro de la ciudad fronteriza de Arica, confirmado por técnicas moleculares. Un canino hembra de 10 años, mestizo siberiano, parasitado con garrapatas presentó un cuadro de hematomas, sangrado bucal profuso y marcado compromiso del estado general. En sus exámenes generales destacaba trombocitopenia (30.000 plaquetas/mm³); un test rápido inmunocromatográfico para Ehrlichia canis fue positivo. La amplificación y secuenciación de un fragmento del gen 16S ARNr a partir de muestra de sangre mostró 100% de homología con E. canis de Perú. Se trata del primer reporte de la presencia de E. canis en Chile, agente de reconocido poder zoonótico.

Identificación morfológica y molecular de filarías caninas en una comuna semi-rural de la Región Metropolitana, Chile / Morphological and molecular identification of canine filariae in a semi-rural district of the Metropolitan Region in Chile

Introduction: To date, there has been no definitive confirmation of the presence of zoonotic dirofilariasis in dogs in Chile. Objectives: To study the presence of dirofilarias in blood samples from dogs collected in a semi-rural district near Santiago and to compare their frequency in dogs with and without dermatological manifestations. Methods: We examined 100 blood samples for dog filariae infections using microscopic methods (modified Knott technique). 50 dogs presented dermatological symptoms or signs compatible with filarial infections and 50 were asymptomatic. ITS-2 and 12s rDNA gene amplification by PCR and sequencing were performed in samples microscopically positive for microfilariae. Results. We observed microfilariae in 22 dogs (22%). Of these, 16/50 (32%) were symptomatic and 6/50 (12%) were asymptomatic (p = 0.02). Morphologically, the majority of micro-filariae were similar to Dirofilaria repens, although many had a bigger size than previously described. Nucleotide sequencing of the amplified genes showed no more than 95% homology with the D. repens sequences available for comparison. D. reconditum and D. dracunculoides infections were also identified. Conclusions: These features might indicate the presence of new species of Dirofilaria or a D. repens close related variant in Chile.

Introducción: A la fecha no hay datos concluyentes en Chile respecto a la presencia de dirofilariasis zoonótica en perros. Objetivos: Identificar la presencia de dirofilarias en sangre de perros de una comuna semi-rural cercana a Santiago y comparar su frecuencia en animales con y sin manifestaciones dermatológicas. Materialy Métodos. Se examinó un frotis sanguíneo de 100 perros en busca de microfilarias mediante observación microscópica (técnica de Knott modificada). Cincuenta perros presentaban síntomas o signos dermatológicos que se han asociado a esta parasitosis y 50 eran asintomáticos. Se amplificaron los genes ITS-2 y 12s ADNr de filarías en las muestras con microfilarias al frotis, secuenciando los fragmentos amplificados. Resultados: Se observaron microfilarias en 22 perros (22%), 16/50 (32%) sintomáticos y 6/50 (12%) asintomáticos (p = 0,02). Morfológicamente, la mayoría de las microfilarias observadas fueron similares a D. repens; sin embargo, una gran proporción mostró un tamaño mayor al descrito para esta especie. Las secuencias nucleotídicas de los genes amplificados mostraron una homología no mayor al 95% con las secuencias de D. repens disponibles para comparación. Se identificaron además dos especies poco patógenas, D. reconditum por morfología y secuenciación genética y D. dracunculoides por morfología. Conclusiones: Los resultados indican la existencia de una nueva especie de Dirofilaria cercanamente relacionada a D. repens o de una variante de esta especie.

Rickettsiosis en América Latina, el Caribe, España y Portugal / Rickettsioses in Latin America, Caribbean, Spain and Portugal

Data on genus and infectious by Rickettsia were retrospectively compiled from the critical review literature regarding all countries in Latin America, Caribbean islands, Portugal and Spain. We considered all Rickettsia records reported for human and/or animal hosts, and/or invertebrate hosts considered being the vector. In a few cases, when no direct detection of a given Rickettsia group or species was available for a given country, the serologic method was considered. A total of 13 Rickettsia species have been recorded in Latin America and the Caribbean. The species with the largest number of country confirmed records were Rickettsia felis (9 countries), R. prowazekii (7 countries), R. typhi (6 countries), R. rickettsii (6 countries), R. amblyommii (5 countries), and R. parkeri (4 countries). The rickettsial records for the Caribbean islands (West Indies) were grouped in only one geographical area. Both R. bellii, R. akari, and Candidatus ‘R. andeane’ have been recorded in only 2 countries each, whereas R. massiliae, R. rhipicephali, R.monteiroi, and R. africae have each been recorded in a single country (in this case, R. africae has been recorded in nine Caribbean Islands). For El Salvador, Honduras, and Nicaragua, no specific Rickettsia has been reported so far, but there have been serological evidence of human or/and animal infection. The following countries remain without any rickettsial records: Belize, Venezuela, Guyana, Surinam, and Paraguay. In addition, except for a few islands, many Caribbean islands remain without records. A total of 12 Rickettsia species have been reported in Spain and Portugal: R. conorii, R. helvetica, R. monacensis, R. felis, R. slovaca, R. raoultii, R. sibirica, R. aeschlimannii, R. rioja, R. massiliae, R. typhi, and R. prowazekii. Amongst these Rickettsia species reported in Spain and Portugal, only R. prowazekii, R. typhi, R. felis, and R. massiliae have also been reported in Latin America. This study summarizes the current...

Fuente de infección de Bordetella pertussis en lactantes hospitalizados por coqueluche / Source of infection in young infants hospitalized with Bordetella pertussis

Background: Despite pertussis vaccination, very young infants have the highest rates of morbidity and mortality caused by the microorganism. Aim: To determine the source of Pertussis infection in infants aged six months or less in Chile. Material and Methods: Twenty six household contacts of 10 young infants hospitalized with confirmed Pertussis were studied for the presence of Bordetella Pertussis by polyme-rase chain reaction (PCR). Clinical and demographic data were analyzed. Results: Respiratory symptoms were present in 20 (77 percent) contacts, being cough the most common. Pertussis cases were identifed in every household and in 18 (72 percent) of the household members. four members with B.pertussis were asymptomatic. Source of infection was identifed in 80 percent (8/10) of the infant cases with ages ranging from 6 to 62 years. Half of primary cases had positive PCR and their cough duration was significantly shorter compared to primary cases with negative PCR. Conclusions: B. pertussis transmission to young infants occurred mainly within the household where adults are generally the source of the infection. Risk factors for infant infection are the same as in developed countries. Therefore, the same strategies, such as routine vaccination in adolescents and adults or cocoon strategy, will help to prevent this disease in infants.

El brote de influenza AH1N1 en tres colegios de la región metropolitana: impacto de las medidas de control adoptadas / Outbreak of H1N1 influenza in three schools in the metropolitan area: impact of control measures

Se compara el impacto de tres estrategias distintas de medidas no farmacológicas (MNF) en tres colegios de la Región Metropolitana en Chile para controlar el brote de influenza AH1N1: colegio A) con suspensión de clases,colegio B) con suspensión selectiva y colegio C) sin suspensión de clases y sin administración de antivirales. Utilizando cuestionarios e información de los colegios, los datos recolectados indican que la tasa de incidenciaacumulada fue 40,3 por ciento (colegio A), 39,6 por ciento (colegio B) y 42,5 por ciento (colegio C). Al restringir la comparación a los dosúltimos colegios, es decir, aquellos en los que la suspensión de clases fue selectiva o bien no hubo suspensión, larazón de tasas (ajustada) del colegio C vs. B fue 1,09 (p = 0,473). A pesar de no alcanzar significancia estadística,este resultado apoya la hipótesis de que la suspensión selectiva de clases tuvo un impacto en reducir la magnituddel brote infeccioso. Los beneficios de una suspensión selectiva de clases (menor tasa de incidencia acumulada ydensidad de incidencia) tienen asociada, sin embargo, una limitación debido a una mayor inasistencia a clases.

The impact of three different strategies of nonpharmacologic measures (MNF) at three schools in the Metropolitan Region in Chile to control outbreaks of influenza AH1N are compared: school A) suspension of classes, school B) selective suspension, C) no suspension of classes and without administration of antiviral drugs. Data collected through questionnaires and information from schools, indicate that the incidence rate was 40.3 percent (school A), 39.6 percent (school B) and 42.5 percent (school C). Restricting the comparison to the last two schools, ie those in which the suspension of classes was selective or no suspension, the rate ratio (adjusted) of C school vs B was 1.09 (p = 0.473). Although not statistically significant, this result supports the hypothesis that the selective suspension of classes had an impact in reducing the magnitude of the outbreak. The benefits of selectively discontinuing classes (lower cumulative incidence and incidence density) are counterbalanced, however, by the limitation of higher non-attendance to school.

Vigilancia epidemiológica de infecciones en pequeños animales de compañía en el Gran Santiago: informe de los primeros seis meses de vigilancia / Epidemiological surveillance of infections in small pets in the Greater Santiago: report of the first six months of surveillance

Este es el primer sistema de vigilancia de infecciones en mascotas en Chile y Latinoamérica. Los primeros 6 meses de funcionamiento del sistema han permitido demostrar la operatividad del diseño y la factibilidad de cumplir los objetivos planteados por los autores. Los resultados hasta ahora obtenidos entregan valiosa información sobre la epidemiología de las enfermedades infecciosas en mascotas, indicándonos la frecuencia relativa de las enfermedades en vigilancia en nuestro medio, y que su frecuencia se asocia en forma directa con los índices de pobreza de las comunas de la región metropolitana. Esta información genera importantes desafíos como son la necesidad de estudiar en mayor profundidad las infecciones en mascotas de mayor potencial zoonótico, tanto del punto de vista de su frecuencia (sarna y tiña) como de su gravedad (brucelosis y leptospirosis). Otros desafíos que surgen son la necesidad de fortalecer la investigación conjunta entre veterinarios, médicos clínicos de salud humana y epidemiólogos; y de progresar en la disponibilidad y calidad de exámenes de laboratorio de apoyo en el área veterinaria de pequeños animales. Finalmente, se espera que esta información pueda ser útil para el diseño de medidas de control más eficaces para estas infecciones.